Бактерии могут присутствовать в клетке в различных контекстах. Например, в микробиологической лаборатории, исследователи могут выращивать бактерии в питательной среде внутри клетки для изучения их свойств и поведения. В организмах, таких как человек или животное, бактерии также могут присутствовать в клетках, например, внутри клеток иммунной системы или внутри клеток, которые образуют симбиотические отношения с бактериями.